NGS技术专刊第五期生物样本保存&运输
拿到样本后直接扔冰箱?运输时只用泡沫箱加冰袋?这些操作可能让你的NGS数据“翻车”!样本保存和运输是测序成功的**步,但80%的科研人都在这一步踩坑。本期NGS技术专刊,一文讲透血液、组织、核酸等样本的正确处理姿势!
为什么样本保存运输是NGS的“生死关”?
NGS技术虽强大,但“垃圾样本进,垃圾数据出”!
常见翻车现场:
血液样本溶血导致游离DNA降解
组织样本反复冻融,RNA断成“二维码”
微生物样本常温运输,活菌变死菌
……
科学依据:样本中的核酸、蛋白质或细胞活性对温度、时间极度敏感,错误保存会直接导致:
基因表达谱失真
微生物多样性数据偏差
低频突变检出失败
超全生物样本保存&运输指南
1、血液样本
类型 | 保存方式 | 运输 | 保存期 |
全血(有核细胞) | 4℃EDTA抗凝管 | 冰袋+4℃恒温箱 | 24h |
血浆/血清 | 分离后-80℃冻存(避免反复冻融) | 干冰运输 | 1年 |
游离DNA | 专用cfDNA保存管 | 常温 | 7天 |
推荐:
LAKEbio游离DNA常温保存管(有注册证,货号:3aB0310.0-100)
2、组织样本
类型 | 保存方式 | 运输 |
新鲜组织 | 切割标本后置于样本冷冻保存管中,液氮或者-80℃冰箱保存 | 干冰运输 |
FFPE样本 | 常温保存,建议不超过半年 | 置于固定液常温运输 |
冰冻切片 | -20℃不超过三个月,-80℃长期保存 | 干冰运输 |
3、核酸样本(DNA/RNA)
类型 | 保存浓度 | 存储温度 | 运输 |
DNA | ≥50ng/μL | -20℃短期 | 冰袋 |
RNA | ≥200ng/μL | -80℃长期 | 干冰 |
推荐:
RNA样本可添加RNA稳定剂
长期储存建议分装至低吸附离心管
麦伯生物1.5ml低吸附离心管(货号:MT-1.5-S-C-LR)
4、微生物样本
类型 | 需氧/厌氧 | 保存液 | 运输 |
肠道菌群 | 厌氧 | 含甘油冷冻保护剂 | -80℃干冰 |
环境微生物 | 需氧 | DNA/RNA Shield | 常温 |
关键点:
活菌运输需使用转运培养基
16S扩增子测序样本建议-80℃保存以防菌群比例变化
样本是NGS的“生命之源”,一次正确的保存选择,可能挽救价值百万的科研数据!
温馨Tips:
(1)样本保存要注意标记清楚编号、样本类型、处理日期、保存条件等。
(2)游离核酸血液样本虽然是常温运输,但是面对极端天气,要采取相应措施:冬季采血管可装在保温容器(例如保温杯)中寄送,注意防撞;夏季,保温容器先在4℃冰箱预冷,然后装采血管寄送,注意防撞。
(3)FFPE样本常温运输要注意高温天气,采取适当降温措施。