文库构建概念
DNA文库构建是二代测序技术的基础,其目的是将待测定样本的大片段基因组DNA片段化为小片段的DNA,之后在小片段DNA分子两端添加测序接头,形成能上机测序的有效文库的过程。文库构建,*终是将待测的DNA或RNA样本转化为适合测序的文库。
文库构建流程
1.打断及末修: 将DNA或RNA打断为适合测序平台的片段大小并修复末端损伤
2.加接头:在片段两端加上特定的接头序列
3.DNA纯化:去除文库中的杂质,提高文库质量
4.文库扩增:通过PCR扩增文库,增加文库的产量
5.文库质检:评估文库的质量,包括文库的浓度、片段大小分布、纯度以及是否存在污染等,以确保文库符合测序要求
文库构建方法
DNA建库方法是分子生物学的实验原理,其本质就是在待测片段两端加上接头的过程,由于NGS测序的应用广泛,不同应用方向的文库制备流程仍有较大差异,目前建库方法包括以下四种。
1. 物理/酶切打断建库
通过物理或酶切打断基因组DNA,然后通过连接酶将接头连接到DNA片段上,*后通过PCR扩增。这种方法可以有效保留样本的几乎所有基因组信息,适用于全基因组测序。包括TA连接接头建库、平末端连接接头建库、Swift法建库!
2. 转座酶建库
转座酶法建库技术的关键是Tn5转座子,Tn5转座子是一种细菌转座子,本质是一段含有若干抗性基因和编辑转座酶基因的DNA片段。转座酶建库利用Tn5转座子将DNA片段化、末端修复、接头连接等多步反应转变为一步反应,大大缩短了建库时间。起始量低至1ng,适用于珍贵的样本或低核酸含量的样本。
3. 杂交捕获建库
杂交捕获根据核酸分子碱基互补配对原则,针对目标区域设计特异探针,打断基因组DNA,加上测序接头后与探针杂交,将基因组DNA目标区域捕获下来,回收目标DNA片段即可。
4. PCR扩增子建库
扩增子建库是指利用PCR反应在待测DNA片段两端加上接头的方法,原理相对比较简单,只需要两轮PCR和两步纯化就可以得到目标区域的文库,**步是含通用序列的引物与目标区域结合,第二步通过PCR反应连接测序接头,使得构建的文库可以用于上机测序。
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麦伯产品信息
产品名称 | 货号 | 规格 |
MagicSeq Tn5 DNA Library Prep Kit for Illumina(for 1ng DNA) | M3111/M3112 | 24次/96次 |
MagicSeq Tn5 Transposase | M3131/M3132 | 100ul/500ul |
MagicSeq Tn5 DNA Library Prep Kit for Illumina(for 50ng DNA) | M3141/M3142 | 24次/96次 |
MagicSeq DNA Library Prep Kit for Illumina | M3151/M3152 | 24次/96次 |
MagicSeq DNA Library Prep Plus Kit for Illumina | M3161/M3162 | 24次/96次 |
MagicSeq DNA Library Prep Kit for MGI | M3191/M3192 | 24次/96次 |
MagicSeq DNA Library Prep Plus Kit for MGI | M3201/M3202 | 24次/96次 |
Magic UDI Adapters for illumina | M321 | 96次 |
MagicSeq Small RNA Library Prep Kit for Illumina | M3221/M3222 | 24次/96次 |